Keahlian Jawatankuasa Pengurusan Universiti (JKPU) adalah berdasarkan kepada Seksyen 23. (1) Akta Universiti dan Kolej Universiti (AUKU) 1971, Perlembagaan Universiti Sains Islam Malaysia seperti berikut:
1. Naib Canselor sebagai Pengerusi
PROFESOR Ts. DR. SHARIFUDIN MD. SHAARANI
Menjalankan Fungsi Naib Canselor
BSc Hons (UKM), MSc (Reading, UK) & Ph.D (Cambridge, UK)
2. Semua Timbalan Naib Canselor
PROFESOR DR. MOHD RADHI IBRAHIM
Timbalan Naib Canselor (Akademik dan Antarabangsa)
BA (Al-Azhar), MA (Malaya), Ph.D (Edinburgh)
PROFESOR DR. ADNAN MOHAMED YUSOFF
Timbalan Naib Canselor (Hal Ehwal Pelajar dan Alumni)
BA (Jordan), MA (Jordan) & Ph.D (UKM)
PROFESOR Ts. DR. SHARIFUDIN MD. SHAARANI
Timbalan Naib Canselor (Penyelidikan dan Inovasi)
BSc Hons (UKM), MSc (Reading, UK) & Ph.D (Cambridge, UK)
3. Pendaftar
DATO’ MUHAMMAD HAIZUAN ROZALI
4. Bursar
SITI NURBAYA ISMAIL
5. Ketua Pustakawan
NOR AZZAH MOMIN
Ketua Pustakawan
M.Sc. Info. Mgt. (UiTM), B.A. (Hons) IRKH (IIUM), Post Gad. Dip. Lib. Sc. (UiTM)
6. Penasihat Undang-Undang
YUHANI JAMIRAN
7. Pegawai Lain Yang Dilantik oleh Naib Canselor
PROFESOR MADYA DR. ASMADDY HARIS
Penolong Naib Canselor (Penjanaan dan Kelestarian Kewangan)
BEc (Hons.) (UUM), Mec (UUM), PhD (UKM)
PROFESOR DR. MOHD YAHYA MOHAMED ARIFFIN
Penolong Naib Canselor (Perancangan Strategik dan Pengantarabangsa)
BA Hons (UKM), MA (UKM), PhD (UM)
IR. AZAHAR AWALLUDIN
PROFESOR MADYA TS. DR. MADIHAH MOHD SAUDI
Ketua Pegawai Maklumat
B.Sc (Hons) Comp. Science (UKM) MSc. Software Eng (UM) Ph.D Computer Security (Bradford) GSEC CERT (SANS Institute,USA) CEH CERT (EC-COUNCIL,USA)