Keahlian Jawatankuasa Pengurusan Universiti (JKPU) adalah berdasarkan kepada Seksyen 23. (1) Akta Universiti dan Kolej Universiti (AUKU) 1971, Perlembagaan Universiti Sains Islam Malaysia seperti berikut:
1. Naib Canselor sebagai Pengerusi
PROFESOR Ts. DR. SHARIFUDIN MD. SHAARANI
Naib Canselor
BSc Hons (UKM), MSc (Reading, UK) & Ph.D (Cambridge, UK)
2. Semua Timbalan Naib Canselor
PROFESOR DR. MOHD RADHI IBRAHIM
Timbalan Naib Canselor (Akademik dan Antarabangsa)
BA (Al-Azhar), MA (Malaya), Ph.D (Edinburgh)
PROFESOR DR. ADNAN MOHAMED YUSOFF
Timbalan Naib Canselor (Hal Ehwal Pelajar dan Alumni)
BA (Jordan), MA (Jordan) & Ph.D (UKM)
PROFESOR DATO’ DR. MUHAMMAD TAUFFIK MOHD NOOR
Timbalan Naib Canselor (Penyelidikan dan Inovasi)
BMed Science (UKM), MD (UKM), Sarjana Kepakaran (Perubatan Keluarga) (UKM)
3. Pendaftar
DATO’ MUHAMMAD HAIZUAN ROZALI
4. Bursar
SITI NURBAYA ISMAIL
5. Ketua Pustakawan
NOR AZZAH MOMIN
Ketua Pustakawan
M.Sc. Info. Mgt. (UiTM), B.A. (Hons) IRKH (IIUM), Post Gad. Dip. Lib. Sc. (UiTM)
6. Penasihat Undang-Undang
YUHANI JAMIRAN
7. Pegawai Lain Yang Dilantik oleh Naib Canselor
PROFESOR MADYA DR. ASMADDY HARIS
Penolong Naib Canselor (Penjanaan dan Kelestarian Kewangan)
BEc (Hons.) (UUM), Mec (UUM), PhD (UKM)
PROFESOR MADYA DR. MAHAZAN ABDUL MUTALIB@TALIB
Penolong Naib Canselor (Perancangan Strategik dan Komunikasi Korporat)
Bach. DIM (USIM), MOrgLead (Monash), PhD (UUM)